La gratuidad es una ayuda estudiantil que cubre el pago de los estudios de los y las estudiantes, en la medida que cumplan con los requisitos para su asignación y mantención, financiando el valor del arancel y matrícula durante la duración formal de la carrera. El beneficio aplica para estudiantes nuevos, antiguos y provenientes de otras instituciones.

A partir del proceso de admisión 2022, el IP Santo Tomás se encuentra adscrito a la gratuidad, luego de que la Comisión Nacional de Acreditación (CNA) acreditara a la institución por cinco años en Nivel Avanzado.

Así, los y las estudiantes que cumplan con los requisitos determinados por el Ministerio de Educación deberán completar el Formulario Único de Acreditación Socioeconómica (FUAS) y esperar el respectivo resultado.